העלייה לקרקע בבני דרום הייתה בחודש אדר תש"ט (1949 )על ידי  גרעין "נתיבות-כפר דרום", חברי גרעין זה הם אלה שלחמו בכפר דרום שבנגב . וגרעין נוסף שנקרא  "מורשה"( מיוצאי אמריקה ודרום אפריקה) אליהם נוספו חניכי כפר הנוער הדתי. קבוצות אלה ייסדו את  בני דרום.

הקבוצה מנתה 35 חברים ו- 6 ילדים והחיים התנהלו על פי עקרונות הקיבוץ הדתי.
הוקצב לישוב שטח של 3000 דונם קרקע פורייה, המבורכת בשפע של מים. עיקר הפרנסה הייתה מגידולים חקלאיים על שטחי קרקע אלו. כמו כן הוקמו לולים לרבייה, ורפת שפעלה עד 1966 .

בשנת תשכ"א –1961 הפך הקיבוץ למושב שיתופי.
משפחות הצטרפו למקום וגם מקורות הפרנסה התרחבו.

ענפי המשק כיום :

• "כד בני דרום" -מפעל לשימורים - זיתים, מלפפונים, חצילים, פלפלים, 
שזיפים, שמן זית ומוצרי גורמה משמן זית.
• מרכז מבקרים-בית בד ומרכז לימודי על שמן הזית.
• לול רבייה גדול.
• "שיבולים" -מפעל לאטריות, פסטות ואיטריות מקמח מלא.
• מחסן מכירות אזורי המספק מוצרי אוכל, חומרי ניקוי וכלים חד פעמים.
• "כיף דרום"-ענף תיירותי.
• גידולי שדה - כותנה וירקות.
• מטעים - אבוקדו, זיתים ופרדס.
• אהבת עולם - בית ספר לחיים.

במקום פועלים פעוטון וגני ילדים של המועצה .הילדים הגדולים של המשק מתחנכים במוסדות המועצה, באולפנות וישיבות בכל רחבי הארץ. לנוער מתקיימת פעילות של בני עקיבא.
לכלל תושבי המשק-שעורים תורניים, קורסים וחוגים, ובמסגרת המתנ"ס , פעילויות שונות כמו מקהלת החבל, חוג מחשבים, חוגי ספורט ושחיה .

בשנים האחרונות הוקמה בצמוד לבתי המשק, שכונת הרחבה למשפחות המעונינות לחיות באווירה כפרית ובצביון קהילתי דתי.

בתחילת שנת 2006 מתגוררות בבני דרום כ 100 משפחות.
67 משפחות במושב השיתופי,
19 משפחות בהרחבה ועוד כ 15 משפחות של תושבים.